猫双眼颜色改变是因为瞳内虹膜色素的改变，致使的双眼颜色的变化。猫双眼的颜色都是因为虹膜上色素的颜色决定的，虹膜色素变化就会致使大家看到猫双眼的颜色出现变化；虹膜色素沉淀和蓝光反射决定了猫的双眼颜色。
猫长大后双眼颜色改变由黑色素决定第一，虹膜色素沉淀和蓝光反射决定了猫科动物的双眼颜色。虹膜的色素沉淀是由黑色素致使的，并且颜色排列从柠檬黄到淡褐色到深橙色或是棕色。另外 透明的双眼结构也象一块玻璃一样反射外来的光线。假如从正面看，玻璃是没颜色的，但大家慢慢移动角度，会看到它呈绿色或是蓝色。同样的，猫科动物双眼的透明结构也呈透明的蓝色，深浅排列从无色到非常深的蓝色或象紫罗蓝那种蓝色。这种蓝色光线反射的颜色组和加上虹膜色素沉淀所产生的颜色构成了猫所有些双眼颜色。 猫的是通过基因遗传虹膜色素沉淀和透明结构色素都是由染色体上不同地方的多个多基因控制的。同窝的小猫从爸爸妈妈那里混合地继承了这类多基因并且产生了不一样的双眼颜色。不一样的多基因混合导至颜色深浅的排列。 纯种猫的两只双眼颜色是一样的，鸳鸯眼一般觉得是杂种所致。这种猫（中国临清猫或土耳其安卡拉猫）多数有遗传缺点，蓝双眼很漂亮，耳朵却是聋的。所以大家用黄双眼白猫跟这种猫杂交，繁育出鸳鸯眼，一只黄、一只蓝双眼的白色长毛猫，就没耳聋的缺点了。
猫的双眼颜色变化出目前6-7周小猫出生时，一般身长为11-15厘米，体重为70至135克。新生小猫双眼尚未睁开，耳朵反摺，所以既看不见也听不见。小猫发育的第一个进展是，5-10天开始睁眼;8-12天双眼才能完全睁开。双眼的颜色一般为灰蓝色，大约在六到七周大时，这种早期的颜色开始变化，蓝膜会褪去，渐渐定型，但也有到三四个月大的时候双眼颜色才固定下来。在一只猫的一生当中，疾病和伤害可以致使双眼颜色的变化。给猫喂鱼并不可以改变颜色给猫吃鱼会让猫的双眼改变颜色这种说法，是无稽之谈!这是由于，在给猫断奶的时候，因为大家给小猫喂鱼（在商业猫粮产生之前，大伙可能都是喂的鱼给小猫)吃，然而恰恰这时，正是小猫的双眼颜色变化的时候，所以才出现了这个误区）。 基本上，小时候虹膜天蓝色或者浅蓝色的，大了还是蓝色;小时候虹膜蓝灰色，大了将来不太会出现蓝色，但是黄色还是绿色或者黄绿可能，终归于它原来的品种应有些眼色素。
